Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms