Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms