Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms