Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EAF1Q96JC9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms