Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms