Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYFIP2Q96F07 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYFIP2Q96F07 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms