Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms