Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG4CQ96DT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms