Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAF2Q96CS3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms