Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNDC1Q96C34 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms