Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms