Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAMP4Q969E2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms