Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-CQ95604 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms