Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms