Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF4Q8WV16 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms