Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIEQ8NEW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms