Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3C3Q8NEB9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms