Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms