Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD1Q8N668 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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