Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME8Q8N427 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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