Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL3Q8IZI9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL3Q8IZI9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms