Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms