Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms