Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms