Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC4Q7Z404 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms