Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CATSPER4Q7RTX7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms