Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTF1AQ7RTS3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms