Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD6Q6ZV73 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms