Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM47EQ6ZV65 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM47EQ6ZV65 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms