Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP47Q6ZTR5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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