Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms