Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 727 ms