Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms