Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms