Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms