Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOM3Q5VTT5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms