Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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