Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWA5B1Q5TIE3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms