Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms