Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf46Q504U0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms