Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms