Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRFIP1Q32MZ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms