Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms