Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX7Q2KHR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms