Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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