Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RTN1Q16799 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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