Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms