Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ZNF56Q15929 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ZNF56Q15929 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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