Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SF1Q15637 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SF1Q15637 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms