Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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